Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mid2Q9QUS6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mid2Q9QUS6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms