Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkl2Q9QUK0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkl2Q9QUK0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms