Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnaja4Q9JMC3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dnaja4Q9JMC3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnaja4Q9JMC3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms