Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reep6Q9JM62 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep6Q9JM62 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep6Q9JM62 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep6Q9JM62 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep6Q9JM62 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep6Q9JM62 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep6Q9JM62 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep6Q9JM62 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep6Q9JM62 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep6Q9JM62 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reep6Q9JM62 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms