Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cul3Q9JLV5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cul3Q9JLV5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms