Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc4apQ9JLV2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc4apQ9JLV2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms