Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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SacsQ9JLC8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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SacsQ9JLC8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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SacsQ9JLC8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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SacsQ9JLC8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SacsQ9JLC8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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