Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cnot9Q9JKY0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cnot9Q9JKY0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms