Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scamp4Q9JKV5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms