Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nectin1Q9JKF6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms