Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ybx3Q9JKB3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ybx3Q9JKB3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms