Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pard6bQ9JK83 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pard6bQ9JK83 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms