Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnga3Q9JJZ8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms