Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tuba8Q9JJZ2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms