Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cacng4Q9JJV4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cacng4Q9JJV4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms