Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ascl3Q9JJR7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ascl3Q9JJR7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms