Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ctnnbip1Q9JJN6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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