Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ69

Kcnip2, Kv channel-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip2Q9JJ69 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip2Q9JJ69 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip2Q9JJ69 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip2Q9JJ69 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip2Q9JJ69 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip2Q9JJ69 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip2Q9JJ69 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip2Q9JJ69 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip2Q9JJ69 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip2Q9JJ69 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip2Q9JJ69 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnip2Q9JJ69 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kcnip2Q9JJ69 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms