Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smad9Q9JIW5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smad9Q9JIW5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms