Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmbr1Q9JIT0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbr1Q9JIT0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms