Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RabggtaQ9JHK4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RabggtaQ9JHK4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms