Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem27Q9ESG4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem27Q9ESG4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms