Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ush1cQ9ES64 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ush1cQ9ES64 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms