Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrnb2Q9ERK7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms