Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc28a3Q9ERH8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc28a3Q9ERH8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms