Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Tfcp2Q9ERA0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms