Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Capn12Q9ER56 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Capn12Q9ER56 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms