Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn1r46Q9EQ45 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r46Q9EQ45 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Vmn1r46Q9EQ45 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vmn1r46Q9EQ45 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Vmn1r46Q9EQ45 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Vmn1r46Q9EQ45 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Vmn1r46Q9EQ45 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Vmn1r46Q9EQ45 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Vmn1r46Q9EQ45 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r46Q9EQ45 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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