Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ropn1lQ9EQ00 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ropn1lQ9EQ00 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms