Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rpgrip1Q9EPQ2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms