Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clstn1Q9EPL2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Clstn1Q9EPL2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms