Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r50Q9EP51 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms