Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Aph1cQ9DCZ9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aph1cQ9DCZ9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms