Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt112Q9DCG9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt112Q9DCG9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt112Q9DCG9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt112Q9DCG9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt112Q9DCG9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt112Q9DCG9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt112Q9DCG9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt112Q9DCG9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt112Q9DCG9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt112Q9DCG9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trmt112Q9DCG9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trmt112Q9DCG9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trmt112Q9DCG9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trmt112Q9DCG9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trmt112Q9DCG9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trmt112Q9DCG9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt112Q9DCG9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt112Q9DCG9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt112Q9DCG9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt112Q9DCG9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt112Q9DCG9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trmt112Q9DCG9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms