Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ftsj3Q9DBE9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ftsj3Q9DBE9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms