Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tysnd1Q9DBA6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tysnd1Q9DBA6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms