Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms