Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmbim4Q9DA39 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmbim4Q9DA39 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms