Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samd8Q9DA37 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms