Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Actrt1Q9D9J3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms