Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D8N1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8N1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8N1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms