Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fip1l1Q9D824 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Fip1l1Q9D824 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms