Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx4ipQ9D7Y9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms