Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cldn23Q9D7D7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cldn23Q9D7D7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn23Q9D7D7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn23Q9D7D7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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