Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms