Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MsraQ9D6Y7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MsraQ9D6Y7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms