Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufb8Q9D6J5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms