Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rhox2aQ9D4Y3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox2aQ9D4Y3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms