Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4931428L18RikQ9D4S9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms