Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Iqcf3Q9D498 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Iqcf3Q9D498 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iqcf3Q9D498 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms